BƯỚC ĐẦU ĐÁNH GIÁ MỨC ĐỘ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA QUẦN THỂ ĐIỀU (Anacardium occidental L.) TẠI TỈNH BÀ RỊA – VŨNG TÀU BẰNG KỸ THUẬT RAPD VÀ AFLP

Mục lục:


Phần 1. Mở đầu......................................................................... 1


1.1. Đặt vấn đề.......................................................................................................................... 1


1.2. Mục đích yêu cầu.............................................................................................................. 1


1.2.1. Mục đích đề tài............................................................................................................... 1


1.2.2. Yêu cầu............................................................................................................................ 2



1.3. Giới hạn của đề tài............................................................................................................ 2





Phần 2. Tổng quan tài liệu........................................................ 3


2.1. Nguyên lý phản ứng
PCR.................................................................................................. 3


2.2. Các thành phần của
phản ứng......................................................................................... 3


2.2.1. Các polymerase chịu nhiệt........................................................................................... 3


2.2.2. DNA khuôn mẫu............................................................................................................ 4


2.2.3. Primer.............................................................................................................................. 4


2.3. Nguyên lý hoạt động của máy PCR................................................................................. 4


2.4. Nguyên lý Pentier................................................................................................................. 5


2.5. Thermoelectric module.................................................................................................... 5


2.5.1. Giới thiệu........................................................................................................................ 5


2.5.2. Cấu tạo
và nguyên lý hoạt động................................................................................... 6


2.5.2.1. Cấu tạo......................................................................................................................... 6


2.5.2.2. Nguyên lý hoạt
động................................................................................................... 7


2.6. Bán dẫn loại N và
bán dẫn loại P.................................................................................... 8


2.7. Sensor nhiệt....................................................................................................................... 9


2.7.1. Nhiệt điện trở
Platine.................................................................................................... 9


2.7.1.1. Cách tính nhiệt độ theo
điện trở............................................................................. 10


2.7.1.2. Sai số cho
phép......................................................................................................... 11


2.7.1.3. Cấu trúc của cảm biến nhiệt platine...................................................................... 11


2.7.1.4. Kỹ thuật nối
dây........................................................................................................ 12


2.7.2. Cặp nhiệt điện.............................................................................................................. 13


2.8. Cấu trúc và đặc tính của chip AT90S8535................................................................. 13


2.9. Ngôn ngữ Bascom........................................................................................................... 15


2.10. Mạch điện...................................................................................................................... 15


2.11. Ứng dụng của PCR........................................................................................................ 15


2.11.1. PCR định lượng.......................................................................................................... 15


2.11.2. PCR sản xuất đột biến
(PCR mutagenesis)


2.11.3. PCR ứng dụng trong cloning tái tổ hợp (cloning of recombinant)..................... 15


2.11.4. PCR nhân bản đoạn
DNA mong muốn.................................................................. 16



2.11.5. PCR dùng
trong phát hiện các vi sinh vật gây bệnh............................................. 17



2.11.6. PCR với
tiến hóa và khảo cổ học............................................................................ 19



2.11.7. PCR với
phát hiện các khiếm khuyết gene............................................................ 19



2.11.8. PCR và
việc định loại các mô.................................................................................. 20



2.11.9. PCR và
việc xác định các dấu ấn di truyền........................................................... 20



2.11.10. PCR và
kỹ thuật phát hiện trình tự chuỗi của một đoạn DNA



(DNA sequencing).................................................................................................................. 21



2.12. Thành phần hóa
học của DNA.................................................................................... 22





Phần 3. Vật liệu và cách thức tiến hành.................................. 24


3.1. Thời gian và địa
điểm tiến hành................................................................................... 24


3.2. Vật liệu............................................................................................................................. 24


3.2.1. Linh kiện
cho bộ khuếch đại tín hiệu từ cảm biến................................................. 24


3.2.2. Linh kiện cho mạch vi xử lý....................................................................................... 24


3.2.3. Linh kiện cho
mạch khuếch đại công suất............................................................... 25


3.2.4. Linh kiện và
thiết bị cho bộ nguồn........................................................................... 25


3.2.5. Linh kiện cho bộ
luân nhiệt và nắp chống ngưng................................................... 25


3.2.6. Vật liệu làm
khung và vỏ máy................................................................................... 25


3.2.7. Hoá chất chạy
PCR và dụng điện di.......................................................................... 26


3.3. Cách thức tiến
hành........................................................................................................ 26


3.3.1. Thiết kế......................................................................................................................... 26


3.3.1.1. Thiết kế khung
và vỏ máy....................................................................................... 26


a. Bộ phận bên ngoài
của máy.............................................................................................. 26


b. Bộ phận bên trong.............................................................................................................. 26


3.3.1.2. Thiết kế bộ phận truyền tải nhiệt cho ống plastic (eppendorf)......................... 28


3.3.1.3. Thiết kế tấm cố định................................................................................................ 28


3.3.1.4. Thiết kế nắp chống ngưng....................................................................................... 29


3.3.2.
Chế tạo.......................................................................................................................... 29


3.3.2.1.
Gia công bộ phận truyền tải nhiệt cho ống plastic (eppendorf)........................ 29


3.3.2.2. Khảo sát
và chế tạo nắp chống ngưng................................................................... 31


3.3.2.3. Làm khung và gò máy.............................................................................................. 31


3.3.2.4. Làm nguồn cung
cấp cho bộ khuyếch đại và vi xử lý......................................... 31


3.3.2.5. Làm mạch
khuyếch đại cho TE.............................................................................. 32


3.3.2.6. Thiết kế và
lắp mạch vi xử lý.................................................................................. 32


3.3.2.7. Làm mạch
khuyếch đại cho Pt100......................................................................... 32


3.3.3. Viết chương
trình và nạp cho vi xử lý...................................................................... 33


3.3.4. Chạy phản ứng PCR..................................................................................................... 33





Phần 4. Kết quả thảo
luận........................................................ 34


4.1. Về phần cứng................................................................................................................... 34


4.1.1. Về bộ phận điều
khiển và nhiệt độ........................................................................... 34


4.1.2. Về toàn phần máy........................................................................................................ 34


4.2. Về phần mền.................................................................................................................... 34


4.3. Về nhiệt độ....................................................................................................................... 35


4.4. Về kết quả chạy mẫu...................................................................................................... 43


4.4.1 Hoạt động của máy....................................................................................................... 44


4.4.2. Chạy phản ứng PCR..................................................................................................... 45





Phần 5. Kết luận và đề
nghị..................................................... 48


5.1. Kết luận............................................................................................................................ 48


5.2. Đề nghị............................................................................................................................. 48


5.2.1. Bộ phận khuyếch
đại................................................................................................... 48


5.2.2. Bộ phận vi xử lý........................................................................................................... 48


5.2.3. Mạch khuyếch đại
Pt................................................................................................... 48


5.2.4. Nguồn điện................................................................................................................... 48


5.2.5. Bàn phím....................................................................................................................... 49


5.2.6. Vỏ và khung................................................................................................................. 49


5.2.7. Chương trình................................................................................................................. 49


5.2.8. Thermoelectric module............................................................................................... 49


5.2.9. Tản nhiệt....................................................................................................................... 49


TÀI LIỆU THAM KHẢO ........................................................ 51


Phụ lục : Chương
trình viết với ngôn ngữ Bascom cho vi điều khiển
Địa chỉ download tài liệu: [You must be registered and logged in to see this link.]