congnghesinhhock31hue
Bạn có muốn phản ứng với tin nhắn này? Vui lòng đăng ký diễn đàn trong một vài cú nhấp chuột hoặc đăng nhập để tiếp tục.
congnghesinhhock31hue

nghien cuu khoa hoc

Tìm kiếm
 
 

Display results as :
 


Rechercher Advanced Search

Latest topics

» Giáo trình động vật học
by aloneba Wed Sep 18, 2013 12:05 pm

» 130 tiểu luận triết học
by VANPHONG Wed Dec 05, 2012 9:22 am

» HỌC TIẾNG ANH ONLINE QUA HELLO CHÀO
by VANPHONG Sat Nov 03, 2012 1:57 am

» Giáo trình tin sinh hoc
by thimy90 Thu Nov 01, 2012 10:40 am

» GIáo trình công nghệ sinh học nano
by vanducchiu Tue Oct 16, 2012 12:01 am

» Phần mềm hat karaoke trên vi tính có chấm điểm
by nguyenhoangquen Thu Sep 20, 2012 11:07 am

» Làm thủ tục hải quan – giao nhận XNK giá rẻ
by nhokbmt Wed Sep 19, 2012 3:08 pm

» NGHIÊN CỨU TẠO CÂY DỨA CAYENNE IN VITRO SẠCH VIRUS GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ (PMWaV- Pineapple mealybug wilt associated virus)
by VANPHONG Thu Sep 13, 2012 8:39 am

» XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP NHẬN DIỆN VÀ PHÂN TÍCH TÍNH ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA 21 DÒNG CACAO (THEOBROMA CACAO L.) BẰNG KỸ THUẬT MICROSATELLITE
by VANPHONG Thu Sep 13, 2012 8:33 am

» XÂY DỰNG CƠ SỞ DỮ LIỆU HAI GENE HSP-70 và REVERSE TRANSCRIPTE-RNaseH Ở MỘT SỐ LOÀI VIRUS THỰC VẬT
by VANPHONG Thu Sep 13, 2012 8:28 am

» BƢỚC ĐẦU XÂY DỰNG QUY TRÌNH ĐỊNH LƢỢNG CÁC SẢN PHẨM BIẾN ĐỔI GEN BẰNG PHƢƠNG PHÁP REAL-TIME PCR
by VANPHONG Thu Sep 13, 2012 8:23 am

» Nghiên cứu đa dạng nguồn gen dứa Cayenne bằng phƣơng pháp marker phân tử
by VANPHONG Wed Sep 12, 2012 9:37 pm

» THU THẬP VÀ TỔ CHỨC DỮ LIỆU GENE PHỤC VỤ NGHIÊN CỨU CÂY TRỒNG BIẾN ĐỔI DI TRUYỀN
by VANPHONG Wed Sep 12, 2012 9:33 pm

» NGHIÊN CỨU KỸ THUẬT VI GHÉP CÂY BƢỞI
by VANPHONG Wed Sep 12, 2012 9:29 pm

» XÂY DỰ NG QUY TRÌNH PHÁT HI Ệ N VIRUS PMWaV-1 GÂY B Ệ NH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ (Mealybug wilt) TRÊN CÂY D Ứ A CAYENNE B ẰNG PHƯƠNG PHÁP RT-PCR
by VANPHONG Tue Sep 11, 2012 11:37 pm

» BƯỚC ĐẦU ĐÁNH GIÁ MỨC ĐỘ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA QUẦN THỂ ĐIỀU (Anacardium occidental L.) TẠI TỈNH BÀ RỊA – VŨNG TÀU BẰNG KỸ THUẬT RAPD VÀ AFLP
by VANPHONG Tue Sep 11, 2012 11:33 pm

» ĐÁNH GIÁ SƠ BỘ MỨC ĐỘ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA QUẦN THỂ ĐIỀU (Acanardium occidentale L.) HIỆN ĐƯỢC TRỒNG TẠI TỈNH NINH THUẬN BẰNG KỸ THUẬT RAPD VÀ AFLP
by VANPHONG Tue Sep 11, 2012 11:30 pm

» “Bƣớc đầu đánh giá mức độ đa dạng di truyền của quần thể điều (Anacardium occidental L.) tại tỉnh Bà Rịa – Vũng Tàu bằng kỹ thuật RAPD và AFLP”.
by VANPHONG Tue Sep 11, 2012 11:25 pm

» NGHIÊN CỨU KHẢ NĂNG CHUYỂN NẠP GEN CỦA HAI GIỐNG BÔNG VẢI COKER312 VÀ VN36P BẰNG VI KHUẨN Agrobacterium tumefaciens
by VANPHONG Tue Sep 11, 2012 11:20 pm

» ĐÁNH GIÁ HÀM LƯỢNG AXIT PHYTIC Ở MỘT SỐ GIỐNG LÚA ĐỊA PHƯƠNG VÀ MỘT SỐ GIỐNG LÚA ĐỘT BIẾN BẰNG PHƯƠNG PHÁP SINH HÓA VÀ MICROSATELLITE
by VANPHONG Tue Sep 11, 2012 11:18 pm

tin tuc sinh học

http://www.agbiotech.com.vn


You are not connected. Please login or register

XÂY DỰNG CƠ SỞ DỮ LIỆU HAI GENE HSP-70 và REVERSE TRANSCRIPTE-RNaseH Ở MỘT SỐ LOÀI VIRUS THỰC VẬT

Go down  Thông điệp [Trang 1 trong tổng số 1 trang]

VANPHONG

VANPHONG
Admin

Mục lục:
Phần 1. LỜI MỞ ĐẦU .................................................................................................. 1
Phần 2. TỔNG QUAN TÀI LIỆU ................................................................................ 4
2.1. SƠ LƢỢC VỀ CƠ SỞ DỮ LIỆU .......................................................................... 4
2.1.1. Định nghĩa .................................................................................................... 4
2.1.2. Hệ quản trị CSDL ......................................................................................... 4
2.1.3. Các mô hình dữ liệu ...................................................................................... 5
2.1.3.1. Định nghĩa ........................................................................................ 5
2.1.3.2. So sánh các mô hình dữ liệu………………………………………..5
2.2. NGÔN NGỮ LẬP TRÌNH PERL, MẠNG INTERNET VÀ WEB .................... 6
2.2.1. Perl ................................................................................................................ 6
2.2.1.1. Tóm tắt lịch sử phát triển .................................................................. 6
2.2.1.2. Ứng dụng .......................................................................................... 7
2.2.1.3. Một số module của Perl thƣờng đƣợc sử dụng ................................. 7
2.2.2. Giới thiệu về mạng Internet ......................................................................... 8
2.2.2.1. Tóm lƣợc lịch sử phát triển ............................................................... 8
2.2.2.2. Một số khái niệm .............................................................................. 9
2.2.3. Web ............................................................................................................... 9
2.2.3.1. Tóm lƣợt lịch sử phát triển ............................................................... 9
2.2.3.2. Tích hợp CSDL với web dùng CGI ................................................ 10
2.3. CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC ........................................................................... 11
2.3.1. NCBI ........................................................................................................... 11
2.3.1.1. Vài nét về NCBI ............................................................................. 11
2.3.1.2. Một số cơ sở dữ liệu trong NCBI.................................................... 11
2.3.1.3. Một số công cụ trong NCBI ............................................................ 12
2.3.2. EBI .............................................................................................................. 13
2.3.2.1. Vài nét về EBI ................................................................................. 13
2.3.2.2. Một số cơ sở dữ liệu trong EBI ....................................................... 13
2.3.2.3. Một số công cụ hỗ trợ phân tích trình tự sinh học .......................... 14
2.3.3. SIB ............................................................................................................. 15
2.3.4. DDJB và PDBj ............................................................................................ 15
2.4. VIRUS CAULIMOVIRIDAE VÀ CLOSTEROVIRIDAE ................................... 18
2.4.1. CAULIMOVIRIDAE ................................................................................... 19
2.4.1.1. Khái quát .......................................................................................... 19
2.4.1.2. Cấu tạo ............................................................................................. 20
2.4.1.3. Đặc tính sinh học ............................................................................. 20
2.4.1.4. Cơ chế xâm nhiễm và sao mã trong tế bào ký chủ .......................... 20
2.4.2. CLOSTEROVIRIDAE ................................................................................. 21
2.4.2.1. Khái quát .......................................................................................... 21
2.4.2.2. Cấu tạo ............................................................................................. 21
2.4.2.3. Cơ chế xâm nhiễm và sao mã trong tế bào ký chủ .......................... 22
2.5. Gene Hsp-70 và Reverse transcriptase-RNaseH ................................................ 23
2.5.1. Gene Reverse transciptase-RNaseH ........................................................... 23
2.5.2.1. Vị trí gene RT-RNaseH nằm trong genome .................................... 23
2.5.2.2. Chức năng của protein ..................................................................... 23
2.5.2. Gene hsp-70 ................................................................................................ 24
2.5.1.1. Vị trí gene hsp-70 nằm trong genome ............................................. 24
2.5.1.2. Chức năng ........................................................................................ 24
PHẦN 3. PHƢƠNG PHÁP VÀ CHƢƠNG TRÌNH SỬ DỤNG ............................. 25
3.1. Các chƣơng trình và ngôn ngữ lập trình đƣợc sử dụng...................................... 25
3.1.1. Hệ điều hành ............................................................................................... 25
3.1.2. Các chƣơng trình phân tích trình tự ........................................................... 25
3.1.2.1. Chƣơng trình so sánh trình tự ClustalW .......................................... 25
3.1.2.2. Chƣơng trình tìm kiếm các trình tự tƣơng đồng – BLAST ............. 25
3.1.2.3. Hệ quả trị CSDL quan hệ MySQL .................................................. 26
3.1.2.4. Apache web Server .......................................................................... 27
3.1.2.5. Ngôn ngữ lập trình Perl và các gói sử dụng .................................... 27
3.2. Phƣơng pháp ....................................................................................................... 28
3.2.1. Thu nhận trình tự ........................................................................................ 28
3.2.2. Xác định gene và protein trong bộ gene virus ............................................ 29
3.2.3. Thiết kế CSDL trình tự gene và protein hsp-70 và RT-RNaseH ................ 32
3.2.3.1. Phân tích dữ liệu .............................................................................. 32
3.2.3.2. Thiết kế CSDL dạng bảng ............................................................... 34
3.2.3.3. Lƣu trữ các thông tin vào CSDL ..................................................... 35
3.2.4. Tích hợp CSDL gene hsp-70 và RT-RNaseH với trang Web .................... 37
Phần 4. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN ....................................................................... 39
4.1. Kết quả thu nhận trình tự của hai họ Closteroviridae và Caulimoviridae .......... 39
4.2. Kết quả thu nhận trình tự hai gene hsp-70 và Reverse transcriptase-RNaseH ... 41
4.3. CSDL trình tự gene hsp-70 và RT-RNaseH ........................................................ 42
4.4. Trang web thể hiện thông tin CSDL gene hsp-70 và RT-RNaseH ..................... 46
4.4.1. Trang thông tin chung về CSDL gene hsp-70 và RT-RNaseH .................... 47
4.4.2. Trang tìm kiếm ............................................................................................ 47
4.4.3. Trang công cụ .............................................................................................. 49
4.4.4. Trang cây phân loài ..................................................................................... 52
4.4.4.1. Trang Caulimoviridae ..................................................................... 52
4.4.4.2. Trang Closteroviridae ..................................................................... 54
4.4.5. Trang liên kết ............................................................................................... 54
4.4.6. Trang thông tin về bộ môn công nghệ sinh học .......................................... 54
PHẦN 5. KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ ......................................................................... 55
4.1. KẾT LUẬN ........................................................................................................ 55
4.2. ĐỀ NGHỊ ........................................................................................................... 55
PHẦN 6. TÀI LIỆU THAM KHẢO .......................................................................... 57
PHỤ LỤC ..................................................................................................................... 59

Địa chỉ download tài liệu: [You must be registered and logged in to see this link.]

https://cnshk31.forumvi.com

Về Đầu Trang  Thông điệp [Trang 1 trong tổng số 1 trang]

Permissions in this forum:
Bạn không có quyền trả lời bài viết